Nell'ambito dell'agricoltura biologica, i compiti dell'ERSA spaziano dalla vigilanza sull'attività degli Organismi di controllo e certificazione biologica operanti sul territorio regionale alla tenuta dell'elenco regionale degli operatori biologici.  L'Agenzia svolge inoltre un'importante attività di formazione e di aggiornamento a favore degli operatori del settore e si occupa di divulgare e promuovere l'intero comparto biologico, in particolare gli aspetti legati alla filiera corta.